בחטיבת אפק מתנהלת תוכנית ייחודית של משרד החינוך לתלמידים מצטיינים. עתודה מדעית טכנולוגית (עמ”ט), הינה תכנית מצוינות יוקרתית אשר חרתה על דגלה והציבה את היעד של העלאת מספר התלמידים המסיימים מתמטיקה 5 יחידות לימוד ושני מקצועות מדעיים/טכנולוגיים מוגברים.
במסגרת תוכנית זו אנו מאתרים תלמידים בעלי פוטנציאל לימודי בתחומי המתמטיקה-מדעים המקבלים שעות תוספתיות במתמטיקה, פיזיקה ומדעי המחשב.