בכל אחת מהשכבות פועלות כיתות ספורט, שנקראות גם כיתות ״חממה״ בשל האופן בו אנחנו מטפחים את הספורטאים ופועלים להצלחה המשולבת שלהם הן בתחום הלימודי והן בענפי הספורט השונים. הספורטאים מגיעים משני ענפים מרכזיים: שחייה וכדורסל. החממה לשחייה פועלת בביה״ס כבר למעלה מעשור וקיבלה מעמד של מגמה על – אזורית, עובדה המעודדת שחיינים מכל האזור ללמוד ב”אפק”. שחייני מכבי ביאליק המקצועניים לומדים ושוחים באותו מתחם, מה שמקל על התנהלותם נוכח משטר האימונים הקשה. הם זוכים למערכת לימודים מותאמת לאימונים ולתחרויות ונהנים משיתוף הפעולה הפורה וההדוק בין בית הספר לבין הנהלת מכבי ביאליק והמאמנים. שחייני ביה״ס מגיעים להישגים מרשימים בתחרויות הארציות ומובילים באליפויות הנוער. החממה לכדורסל נולדה אף היא משיתוף פעולה בין הנהלת ביה״ס להנהלת מכבי ביאליק בכדורסל. גם כאן זוכים הכדורסלנים למערכת מותאמת לאימונים יומיומיים במסגרת ביה״ס. כיתות הספורט נהנות מרמת אימונים גבוהה אצל מיטב המאמנים ועליהן גאוותנו. בנוסף, אנו פועלים בשנה הבאה לפתיחת מגמת טריאתלון בשכבת ז’.